پودر آگارز (Agarose)

پودر آگارز ۵ گرمی دنازیست. آگارز یک پلی ساکارید طبیعی است که از جلبک‌های دریایی به دست می‌آید. در آزمایشگاه‌های بیولوژی مولکولی، آگارز  برای ساخت ژل‌ الکتروفورز استفاده می‌شود. ژل الکتروفورز یک روش فیزیکی است که با استفاده از یک میدان الکتریکی، مولکول‌های مختلف را بر اساس اندازه، شکل و بار الکتریکی از هم جدا می‌کند. آگارز به عنوان یک ماده اساسی در آزمایشگاه‌های بیولوژی مولکولی برای جداسازی و مشاهده مولکول‌های DNA و RNA استفاده می‌شود.

ویژگی‌ها و کاربردهای پودر آگارز

• ساخت ژل: وقتی پودر آگارز با آب مخلوط و گرم می‌شود، به محلولی با ویسکوزیته بالا تبدیل می‌شود. با سرد شدن این محلول، یک ژل سفت و شفاف تشکیل می‌دهد. آگارز معمولاً به صورت پودر در بازار عرضه می‌شود. برای ساخت ژل، مقدار معینی از این پودر در آب یا بافر مناسب الکتروفورز (TAE یا TBE) حل شده و سپس گرم می‌شود تا بصورت ژل در بیاید.
• پوروزیته (Porosity) مناسب: ژل آگارز دارای یک شبکه منظم از منافذ است که اجازه می‌دهد مولکول‌های DNA یا RNA با اندازه‌های مختلف از طریق آن حرکت کنند. بنابراین، قابلیت جداسازی مولکول‌های با اندازه‌های متفاوت را فراهم می‌آورد. می‌توان با استفاده از مواد رنگی مانند اتیدیوم بروماید یا سایر رنگ‌های فلورسنت، نوارهای DNA در ژل آگارز را مشاهده کرد.
• کاربردها: آگارز عمدتاً برای الکتروفورز DNA استفاده می‌شود. بسته به درصد آگارزی که در تهیه ژل استفاده شده، می‌توان قطعات DNA با اندازه‌های متفاوت را جدا کرد.
• بی‌ضرری: آگارز بی‌ضرر است و به دلیل خصوصیات غیر توکسیک و بیولوژیکی‌اش، در آزمایشگاه‌ها و صنایع داروسازی استفاده می‌شود.

ویژگی های پودر آگارز برای ساخت ژل الکتروفورز

برای ساخت ژل الکتروفورز، نیاز به پودر آگارز با کیفیت بالا و خالص دارید. پودر آگارزی که استفاده میکنید باید دارای خصوصیات زیر باشد:

• درصد ژل کنندگی مناسب: این خصوصیت نشان دهنده قدرت ژل کنندگی آگارز در حضور آب است. اگر درصد ژل کنندگی زیاد باشد، ژل بسیار سفت و نامطمئن خواهد شد. اگر درصد ژل کنندگی کم باشد، ژل شل و نامنظم خواهد شد.
• درجه خلوص بالا: این خصوصیت نشان دهنده خلوص آگارز از آلودگی های مختلف است. اگر پودر آگارز دارای آلودگی هایی مانند رنگ، بو، سولفات، نمک، فلزات سنگین و مواد آلی باشد، کیفیت ژل الکتروفورز تحت تأثیر قرار خواهد گرفت.
• قابلیت حلال شدن سریع و آسان در بافر: این خصوصیت نشان دهنده رفتار فیزیکوشیمیایی آگارز در حضور حرارت است. اگر پودر آگارز به راحتی در آب حل شود، مقدار کمتری از آن برای تهیه ژل الکتروفورز لازم خواهد بود. همچنین، احتمال تشکیل دانه های ناهمگن در ژل کاهش خواهد یافت.

محصول پودر آگارز دنازیست با توجه به این خصوصیات در اختیار پژوهشگران گرامی قرار میگیرد. دنازیست با کنترل دوره‌ای و روش های کنترل کیفی دقیق، محصول پودر آگارز خود را به شما ارائه می‌کند.

با پودر آگارز دنازیست، تجربه ژل الکتروفورز با کیفیت بالا و نتایج قابل اعتماد را خواهید داشت.

در این مطلب آموزشی از بلاگ دنازیست، روش تجزیه و تحلیل یک نمونه RNA‌ استخراج شده توسط ژل الکتروفورز را بررسی می‌کنیم:

۴ پارامتر (معیار) کلیدی که باید بعد از استخراج RNA بررسی شوند:

راهنمای عملی سنجش (آنالیز) کیفیت RNA استخراج شده