کیت استخراج DNA‌ از باکتری

کیت استخراج DNA‌ از باکتری برای استخراج DNA ژنومیک از میکروارگانیسم‌ها و باکتری‌های گرم منفی و گرم مثبت در محیط کشت باکتری و مایعات بیولوژیک مانند ادرار، بزاق، خلط و کلنی طراحی شده است.

با استفاده از این کیت می توان DNA ژنومیک را در کوتاهترین زمان و با کیفیت بالا استخراج کرد.

DNA استخراج شده می تواند در بسیاری از واکنش های پائین دست از جمله PCR، تعیین توالی، تعیین ژنوتایپ، و انواع هیبریدیزاسیون از جمله Southern blotting مورد استفاده قرار گیرد.

نحوه ارسال: اجزای کیت به استثنای آنزیم ها به طور عادی ارسال می گردند. آنزیم های مورد استفاده در کیت در کنار یخ ارسال می شوند.

مزایای استفاده از کیت استخراج DNA از باکتری

• استخراج DNA با کیفیت بالا؛
• شکست دیواره باکتری‌های سخت (با لایه پپتیدوگلیکان خیلی ضخیم) با کمک بافرهای قوی لیزکننده سلول و glass bead به راحتی انجام می‌گیرد.

نکات قابل توجه در رابطه با کیت استخراج DNA از باکتری

• در مراحل اولیه بعد از اضافه کردن بافر ۱ و ۲ اگر رسوب قابل مشاهده نبود باید مراحل اولیه بررسی شود، احتمالا میزان باکتری در نمونه اولیه خیلی پایین بوده و یا لیز سلولی به خوبی انجام نگرفته است؛
• با توجه به اینکه میزان باکتری در نمونه اولیه میزان الوشن (elution) نهایی با حداقل مقدار انجام گیرد؛
• مراحل انجام استخراج نسبت به بقیه کیت‌های این شرکت طولانی‌تر می‌باشد.

این کیت در دو نوع ۲۵ و ۵۰ عددی موجود می‌باشد.

DENAzist Bacterial DNA isolation kit is designed for the extraction of genomic DNA from microorganisms and gram positive and negative bacteria in biological fluids including ruminal fluid, urine, saliva, and sputum and cultured colonies. The extracted DNA could be used in a multitude of downstream procedures including PCR, genotyping, DNA digestion, and sequencing.

S-1035 for 25 applications
S-1035-1 for 50 applications

محلول‌های موجود در کیت استخراج DNA از باکتری:

• محلول DB1: دارای ترکیب خاص نمک و دترجنت بوده و باعث شکست دیواره باکتریایی شده و در اتصال DNA به ستون کمک می‌کند.
• محلول DB2: دارای ترکیب خاص نمک می‌باشد و در در اتصال DNA به ستون کمک می‌کند.
• محلول DB3: برای شستشوی ستون حاوی ِDNA کاربرد دارد. در حین شستشو با این محلول DNA به طور متصل با ستون باقی می‌ماند.
• محلول DB4: برای آزادسازی و بازیابی DNA (یا elution) از ستون استفاده می‌شود.

References

Toloue Naddaf Abkouhi M, Tabatabaei Yazdi F, Mortazavi SA, Edalatian Dovom M. Identification of Alkaline Protease Producing Bacilli from Sludge of Bactofuge and Separator Using Culture–Based and Molecular Techniques. Journal of Agricultural Science and Technology. (2019) 21(7): 1819-1830

Eskandari Torbaghana M, Khalili Torghabeh GH. Biological removal of iron and sulfate from synthetic wastewater of cotton delinting factory by using halophilic sulfate-reducing bacteria. Heliyon (2019) 5 (12) e02948.

Bahrami-Teimoori, B.; Pourianfar, H. R.; Akhlaghi, M.; Tanhaeian, A.; Rezayi, M. Biosynthesis and Antibiotic Activity of Silver Nanoparticles Using Different Sources: Glass Industrial Sewage-Adapted Bacillus Sp. and Herbaceous Amaranthus Sp. Biotechnology and Applied Biochemistry 2019

Bafekr, J. J.; Jalal, R. In Vitro Antibacterial Activity of Ceftazidime, Unlike Ciprofloxacin, Improves in the Presence of ZnO Nanofluids under Acidic Conditions. IET nanobiotechnology 2018, 12 (5), 640–646

Ghasemi, F.; Jalal, R. Antimicrobial Action of Zinc Oxide Nanoparticles in Combination with Ciprofloxacin and Ceftazidime against Multidrug-Resistant Acinetobacter Baumannii. Journal of global antimicrobial resistance 2016, 6, 118–122